對含有未知組分的樣品，首先必須將其分離，然后才能對有關組分進行進一步的分析。混合物的分離是基于組分的物理化學性質的差異，該色譜儀主要是利用物質的沸點、極性及吸附性質的差異來實現混合物的分離。

　　氣相色譜儀分析室的要求如下：

　　（1）分析室周圍不得有強磁場，易燃及強腐蝕性氣體。

　　（2）室內環境溫度應在5~35度范圍內，濕度小于等于85%（相對濕度），且室內應保持空氣流通。有條件的廠好安裝空調。

　　（3）準備好能承受整套儀器，寬高適中，便于操作的工作平臺。一般工廠以水泥平臺較佳（高0.6~0.8米），平臺不能緊靠墻，應離墻0.5~1.0米，便于接線及檢修用。

　　（4）供儀器使用的動力線路容量應在10KVA左右，而且儀器使用電源應盡可能不與大功率耗電量設備或經常大幅度變化的用電設備公用一條線。電源必須接地良好，一般在潮濕地面（或食鹽溶液灌注）釘入長約0.5~1.0米的鐵棒（絲），然后將電源接地點與之相連，總之要求接地電阻小于1歐姆即可。（注：建議電源和外殼都接地，這樣效果更好）。

　　氣相色譜儀開箱后，按資料袋內附件清單，進行逐項清點，并將易損零件的備件予以妥善保存。然后按照儀器的使用說明書上要求，將其放置于工作平臺上，并對著接線圖和各插頭，插座將儀器各部分連接起來，后連接記錄儀和數據處理機。注意各接頭不要接錯。